O Controle Interno, no âmbito do RPPS, integra a estrutura organizacional da Administração com a função de acompanhar a execução dos atos da gestão do RPPS e apontar, em caráter sugestivo, preventivo ou corretivo, as ações do órgão.

Outra função do Controle Interno é de caráter opinativo, considerando que a gestão pode ou não atender às propostas indicadas. Em todos os casos, a responsabilidade e riscos dos atos praticados são da gestão do regime.